Штатный органист Томской государственной филармонии. Лауреат V Всероссийского конкурса органистов в Казани и II Международного конкурса «Organo Duo».
Родился в 1979 году в Москве. С 12 лет начал обучаться игре на органе под руководством преподавателя Екатерины Прочаковой. Окончил Академический музыкальный колледж при Московской консерватории, Казанскую консерваторию по специальности «орган» и аспирантуру Московской консерватории (2007, над кандидатской диссертацией работал под руководством профессора В.С. Ценовой). Принимал участие в мастер-классах ведущих европейских органистов, в 2010 году стажировался в Летней академии в Харлеме (Нидерланды).
Ведёт активную концертную деятельность в России и за рубежом. Принимал участие во всероссийских и международных фестивалях, таких как «От Рождества до Рождества», «Музыка в изгнании», «Livadia-fest», а также в концертах праздничной юбилейной недели Дитриха Букстехуде в Любеке. В 2009 году при поддержке Княжества Лихтенштейн организовал фестиваль Rheinberger-Fest к 170-летию немецкого композитора и органиста Йозефа Райнбергера. Записи звучали в эфире радиостанций классической музыки Австрии, Белоруссии, Бельгии, Латвии и Швеции.
С 1998 года — органист храма Св. Людовика Французского в Москве. С 2011 года — музыкальный руководитель и органист в Евангелическо-лютеранском Кафедральном соборе св. Петра и Павла. Работал ведущим на радиостанции классической музыки «Орфей» (проекты «Еврорадио представляет», «Евромикс», «И.С. Бах и его кантаты», «Моцарт сегодня», «Открытый урок»).
С 2012 года является штатным органистом Томской областной государственной филармонии (в 2013–2018 годах — художественный руководитель). Провёл множество абонементных циклов, таких как «Орган плюс», «Органная классика», «Сказки дядюшки органа», «Золотой альбом», «4 темперамента в 4 руки», «4 стороны света», «Истории, изменившие мир», «Органные тайны: музыка, люди, эпохи». По его инициативе Томская филармония первой в России начала проводить ежесезонный абонемент «Два короля», посвящённый музыке для органа и оркестра. Также Дмитрий Ушаков инициировал проведение «интерактивных концертов», программу которых определяют сами слушатели.
С 2017 года – органист храма Покрова Пресвятой Богородицы в Томске.
В репертуаре Дмитрия Ушакова — музыка самых разных стилей, эпох и жанров, в том числе — большое количество транскрипций и переложений для органа. Музыкант является автором научных статей по истории и теории органного искусства, ежегодно проводит серию мастер-классов в Саратовской консерватории. В 2012 году вёл на кафедре органа и клавесина Российской академии музыки им. Гнесиных дисциплины «История и теория западноевропейской церковной музыки» и «Орган в литургии».