Окончил Московскую консерваторию в классе профессора Геннадия Рождественского. В студенческие годы состоялся дебют Мурада Аннамамедова с Государственным симфоническим оркестром Туркменистана.
В разные годы работал с Государственным симфоническим оркестром Туркменской ССР, Саратовским симфоническим оркестром, в 1994 году возглавил Ярославский симфонический оркестр. За годы работы с Ярославским оркестром было создано множество творческих проектов и программ, представляющих не только симфоническую музыку, но и постановки опер и балетов, которые принесли оркестру заслуженное признание и любовь публики.
В течение ряда лет возглавлял Государственную экзаменационную комиссию на дирижерской кафедре Московской консерватории и Академии им. Гнесиных. В 2005 году учредил премию имени Геннадия Рождественского для лучших выпускников-дирижеров, а в 2011 году - Золотую медаль Геннадия Рождественского.