Родился в 1978 году в Нанси.
Обучался органу у Кристофа Мантуа, историческому исполнительству у Мартина Гестера и клавесину у Алине Зильберайх в Национальной консерватории в Страсбурге, где был удостоен первого органного приза.
После окончания консерватории в Страсбурге обучался в Национальной Парижской консерватории у Мишеля Бувара и Оливье Латри, где также получил несколько первых органных призов.
В 2004 году Йоанн Вексо был удостоен посла органиста хорового органа собора Нотр-Дам де Пари. С 2009 параллельно является органистом кафедрального собора в Нанси и занимает должность органиста в соборе Нотр-Дам де Пари.
Играет множество концертов по всему миру – в Европе, Америке, Азии и Африке. Записал множество компакт-дисков на исторических французских органах, особое место среди которых занимают записи на органе собора Нотр-Дам де Пари.
